Биоинформатик (тематика - онкология)

Обязанности

• биоинформатический анализ результатов молекулярного-генетических исследований: полногеномное секвенирование, таргетное секвенирование ДНК и РНК, bulk РНК-секвенирование, анализ метилирования ДНК; системно-биологический анализ данных, включая анализ мультиомиксных данных; разработка и дополнение пайплайнов анализа данных; работа с базами данных: парсинг общедоступных биомедицинских баз данных, работа с локальными базами данных; анализ качества данных, включая применение методов статистического анализа, визуализации данных; подготовка научных публикаций, патентов.

Требования

• высшее образование, специальности: биоинформатика, биофизика, биоинженерия или математика/программирование с дополнительной специализацией в биоинформатике; уверенные навыки программирования: знание R (Bioconductor), Python (Biopython, Pandas, Numpy как минимум, знание/применение других библиотек будет преимуществом); уверенное владение Linux, знание Bash, навыки работы в командной строке; опыт работы с NGS-данными на уровне разработки биоинформатических пайплайнов анализа данных (геном, транскриптом, метилом, таргетное секвенирование панелей генов); опыт работы с Docker, Git; опыт работы с SQL; знание биомедицинской статистики; опыт научной деятельности не менее 2 лет; аналитический склад ума, педантичность, методичность, ориентированность на результат; английский язык не ниже уровня Intermediate.
• Опционально: знание алгоритмов и методик системно-биологического анализа; знание хотя бы одного из следующих языков программирования: Perl, C++, Julia, Java, JavaScript; владение хотя бы одним из следующих инструментов: MathCAD, MatLab, Wolfram Matematica, Octave; опыт математического моделирования, навыки создания ML-моделей, наличие дополнительного образования (повышение квалификации) в областях молекулярной биологии/онкологии/клеточной биологии/генетики.

Квалификация

• диплом, сертификат